1、蛋白酶抑制因子
蛋白酶抑制因子包括胰蛋白酶抑制因子和胰凝乳蛋白酶抑制因子，能够抑制动物肠道中蛋白质水解酶对饲料的水解作用，进而阻碍动物对饲料蛋白质的消化、吸收和利用，主要存在于生大豆中，能够降低胰蛋白酶、胃蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、枯草杆菌蛋白酶、凝血酶等十几种酶的活性。
蛋白酶抑制因子可以保护植物本身，可以防止大豆自身发生分解代谢，以保证大豆种子处于休眠状态，同时还具有抵抗虫害的作用。但蛋白酶抑制因子对人和动物就是一种抗营养因子，能够造成动物生长发育缓慢或停滞，引起动物胰腺增大、功能亢进，致使必需氨基酸的内源性损失，尤其是含硫氨基酸损失更为明显。
2、水溶性非淀粉多糖
水溶性非淀粉多糖是指饲料中除去淀粉和蛋白质外，能溶于水而不溶于80%乙醇的多糖。主要有阿拉伯木聚糖、β-葡聚糖、甘露寡糖、葡萄甘露寡糖、果胶等。水溶性非淀粉多糖能够增加小肠内容物的黏度，降低消化酶在小肠内容物中的扩散速度，从而减缓酶解作用；水溶性非淀粉多糖还能减少机体对营养成分的吸收，而蓄积在肠道内，给肠道中大量有害微生物提供良好的繁殖环境，改变肠道内的酸碱度，降低消化酶的酶解作用，同时刺激肠壁，导致肠绒毛损伤，使肠壁增厚，出现黏膜形态和机能的变化，进一步降低营养成分的吸收；另外，水溶性非淀粉多糖可以与胆汁酸结合，限制其作用；与胆固醇、脂肪结合，造成脂肪消化和吸收显着减少，尤其是饱和脂肪酸更为明显。
3、抗原蛋白
抗原蛋白是指饲料中的大分子蛋白质或糖蛋白，人或动物采食后能够改变体液免疫功能，所以又称为致敏因子。多数豆类、花生及其饼、粕中都含有抗原蛋白。饲料中的抗原蛋白能够引起仔猪、牛犊等的过敏反应。
4、芥子碱和芥酸
芥子碱是4-羟基-3，5-二甲氧基苯丙烯胆碱酯。芥子碱可以在水中溶解，它性质活跃，在自然条件下容易发生非酶化的水解反应，分解为芥子碱和胆碱。芥子碱味苦，是造成菜籽饼粕适口性差的主要原因。芥酸是一种不饱和脂肪酸，可以在油脂中溶解，在油菜等十字花科作物种子中含量较多，人与动物食用大量芥酸后能够引起心肌脂肪沉积和心肌坏死。
5、棉酚及其衍生物
棉酚是锦葵科棉属植物色素腺产生的一种高活性的多酚二萘衍生物，是棉籽色素腺体中最主要的色素。含活性醛基和活性羟基的游离棉酚毒性最大，变性棉酚毒性比较小，结合棉酚基本没有毒性。结合棉酚是游离棉酚和蛋白质、磷脂、氨基酸等物质结合而成，失去了活性，不能被人或畜禽消化、吸收。游离棉酚易溶于油、乙醚等一般的有机溶剂，结合棉酚—般不溶于油、丙酮等有机溶剂。棉酚的衍生物棉紫酚、棉绿酚、二氨基棉酚等都属于有毒性的抗营养因子。
游离棉酚对细胞、神经、血管等有毒害作用；能够降低棉籽饼、粕中赖氨酸的有效利用率；降低雄性动物的生殖功能；扰乱动物机体正常的生理机能；降低鸡蛋品质。
6、硫代葡萄糖苷
硫代葡萄糖苷是芥子苷和葡萄糖苷的总称，由葡萄糖和带有一个硫酸根的异硫氰酸酯缩合而成，在自然界中主要以钾盐形式存在。硫代葡萄糖苷存在于十字花科(油菜、白菜、萝卜、青菜、甘蓝等)植物中。这些植物的根、茎、叶、花和种子等都含有硫代葡萄糖苷，其种子中含量最高。硫代葡萄糖苷本身不具有抗营养作用，但在加工过程中，在芥子酶(硫代葡萄糖苷酶)的作用下生成甲状腺肿素等多种有毒有害物质。猪、兔和家禽等对硫代葡萄糖苷比较敏感，而牛、羊、骆驼等反刍动物对硫代葡萄糖苷的耐受量相对较大。如果长时间饲喂或大量采食也能影响反刍动物的生殖性能，引起甲状腺机能紊乱等病理现象。
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