全基因组选择技术与种猪育种

在影响生猪效益的诸多因素中，优良的种猪起主导作用。选种是种猪遗传改良的关键环节，提高选种的准确性是育种工作者的主要任务。当前，全基因组选择技术研究已成为猪育种工作的重要内容。

相比传统的育种技术，全基因组选择的主要特点是利用全基因组遗传标记信息，实现对个体的选择，以加快遗传进展，提高育种效率。

种猪改良最关键部分在于选种，目前主要通过个体本身和有亲缘关系个体的表型值，以BLUP法估计个体育种值，再根据育种值进行选种。个体育种值实际是由基因控制的，如何选择控制表型值的基因，在基因水平上直接选种，是育种工作的难点。

回顾选种技术的发展，早在我国春秋时期就有伯乐相马、宁戚相牛的典故，他是通过血统来源结合对部分性状经验的判断来选种的，这是一种通过表型值结合系谱的选择方法；随着数量遗传学的发展，到70年代科学家建立了BLUP的遗传分析方法，这是一种计算技术，将大量的表型值估算成个体育种值，这种方法更科学、更准确；随着分子生物学的发展，发现了一些性状的主效基因或关联主效基因的位点，建立了标记辅助选择结合BLUP估计育种值方法；近十年来，全基因组选择技术得到了蓬勃的发展，可以显著提高育种效率。

全基因组选择的基本原理是个体间存在大量的SNP(单核苷酸多态性，也即基因组序列的差异位点)，这些SNP与性状间有连锁和不完全连锁的关系，每一个SNP可以建立一个基因育种值。个体性状基因组育种值就是大量SNP效应的累加值。因此，可以由基因型估计育种值，根据育种值高低进行选种。

全基因组选择的基本步骤分为两部分。第一步是建立参考群，参考群的每个个体需有表型数据和SNP基因型，通过统计模型计算SNP效应得到个体基因组育种值；第二步是测定候选群体SNP的基因型，利用第一步得到的SNP效应，计算个体的基因组育种值，再根据基因组育种值选留个体。

全基因组选择技术的三个关键点：第一是参考群体，第二是SNP分型技术，第三是统计模型算法。

二、全基因组选择育种相关关键技术

当参考群体的个体数量达到8000头时，使用全基因组选择和BLUP的准确性相当。随着个体数量的增加，全基因组选择的准确性也会逐步提高，因此对某性状的选择，需要建立一个超过8000头个体的表型和基因型数据库。参考群体的建立对全基因组选择是至关重要的，也是开展该技术选育的前提条件。

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