一、加强猪舍排水和消毒
1、排水：目前很多小型猪场都是依靠山坡而建，或很多是建在比较低洼的田园间，这样排水将会是一个很大的难题，特别是暴雨来临时，在短时间内大量的水往往无法排出，水流入猪舍，将引起猪群受灾。因此为了避免发生这样的情况，必须对猪舍周边的排水沟进行及时的清理或深挖，应急情况下可加高猪舍的门槛，对于比较低洼的猪舍，可采用紧急转移的方法将猪群转走。
2、病死、溺死猪只进行无害化处理：受灾过程中，不少猪只被水冲散、发病，发生大量死亡。死亡猪体内带有大量致病微生物，如不及时进行无害化处理，任其腐烂发臭，病菌会随水流、空气到处扩散，不仅污染环境，还容易引起人、猪疫病流行。对死亡猪只尸体最简单有效的处理方法是深埋，深埋应选择高岗地带，坑深在2米以上，尸体入坑后，撒上石灰或消毒药水，覆盖厚土，有条件的地方可以焚烧。
3、消毒：积水排净后，要加强消毒。除了清扫、冲刷、洗擦、日晒、焚烧、堆积发酵等物理消毒和生物学消毒方法以外，化学消毒应用最广泛，下面介绍几种常用消毒药品及其使用方法：
石灰水：用新鲜石灰配成的10%~20%的石灰水，可用来消毒场地，粉刷棚圈墙壁、桩柱等。石灰水的配制方法：1公斤生石灰加4~9公斤水。先将生石灰放在桶内，加少量水使其溶解，然后加足水量。石灰水现配现用，放置时间过长会失效。
草木灰水：适用于对棚圈、用具和器械等消毒。草木灰水配制方法：在10公斤水中加2~3公斤新鲜草木灰，加热煮沸（或用热水浸泡3昼夜），待草木灰水澄清后使用，将草木灰水加热后使用才有显著的消毒效果。
烧碱：2%烧碱溶液可用来消毒棚圈、场地、用具和车辆等。3%~5%的烧碱溶液，可消毒被炭疽芽孢污染的地面。消毒棚圈时，将家畜赶（牵）出栏圈，经半天时间，将消毒过的饲槽、水槽、水泥地或木板地用水冲洗后，再让家畜进圈。
过氧乙酸：2%~5%的过氧乙酸溶液，可喷雾消毒棚圈、场地、墙壁、用具、车船、粪便等。
复合酚：复合酚100~300倍液适用于消毒畜舍、场地、污物等。
百毒杀：用百毒杀3000倍稀释液喷洒、冲洗、浸渍，可用来消毒畜舍、环境、机械、器具、种蛋等，百毒杀2000倍液可用于紧急预防畜禽舍的消毒。百毒杀10000~20000倍稀释液可预防储水塔、饮水器被污物堵塞，可以杀死微生物、除藻、除臭、改善水质。
4、灭蚊灭蝇：高湿高温、污水四处横流，最容易滋生蚊虫，附红体病、弓形体病、圆环病毒往往是由蚊虫叮咬所引起。应尽量割除猪舍周边的杂草，定期清理排水沟，搞好栏舍卫生，平时用完的药物瓶子、袋子等不要到处乱扔，要集中安排销毁或深埋。另外在饲料里面添加环丙氨嗪可以有效地清除蚊虫的幼卵，减少蚊虫滋生。
二、突击抓好免疫和检疫监督
特大洪水灾害极易造成疫病流行，一些多年不发生或很少发生的疫病，如猪丹毒、猪肺疫、猪瘟等，可能会因此发生。一些在正常年份不会发生的疾病如炭疽病，也有可能发生。灾后补栏增养也需要及时防疫。因此当前必须突击抓好防疫工作。根据本地畜禽疫病流行情况，突出防疫工作的重点。
洪水灾害使病原大量扩散，疫病极易流行。另外灾后急需补栏，苗猪普遍不足，需要到外地调运，稍有不慎，就会带进疫病。因此检疫检验工作显得尤为重要。这项工作是切断疫源传播，防止疫病传入和流行的关键所在，必须抓好。
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